2a3w

From PDBWiki

Jump to: navigation, search
2a3w

Decameric structure of human serum amyloid P-component bound to Bis-1,2-{[(Z)-2-carboxy-2-methyl-1,3-dioxane]-5-yloxycarbamoyl}-ethane

Authors Ho, J.G. Kitov, P.I. Paszkiewicz, E. Sadowska, J. Bundle, D.R. Ng, K.K.
Citation Ligand-assisted Aggregation of Proteins: DIMERIZATION OF SERUM AMYLOID P COMPONENT BY BIVALENT LIGANDS. PubMed
Release date 2005-09-27
Exp. Method X-RAY DIFFRACTION
Resolution 2.2 Å
Classification METAL BINDING PROTEIN

Sequence

Chain A (204 residues): Blast Uniprot
HTDLSGKVFVFPRESVTDHVNLITPLEKPLQNFTLCFRAYSDLSRAYSLFSYNTQGRDNELLVYKERVGEYSLYIGRHKV
TSKVIEKFPAPVHICVSWESSSGIAEFWINGTPLVKKGLRQGYFVEAQPKIVLGQEQDSYGGKFDRSQSFVGEIGDLYMW
DSVLPPENILSAYQGTPLPANILDWQALNYEIRGYVIIKPLVWV
Chain B (204 residues): Blast Uniprot
HTDLSGKVFVFPRESVTDHVNLITPLEKPLQNFTLCFRAYSDLSRAYSLFSYNTQGRDNELLVYKERVGEYSLYIGRHKV
TSKVIEKFPAPVHICVSWESSSGIAEFWINGTPLVKKGLRQGYFVEAQPKIVLGQEQDSYGGKFDRSQSFVGEIGDLYMW
DSVLPPENILSAYQGTPLPANILDWQALNYEIRGYVIIKPLVWV
Chain C (204 residues): Blast Uniprot
HTDLSGKVFVFPRESVTDHVNLITPLEKPLQNFTLCFRAYSDLSRAYSLFSYNTQGRDNELLVYKERVGEYSLYIGRHKV
TSKVIEKFPAPVHICVSWESSSGIAEFWINGTPLVKKGLRQGYFVEAQPKIVLGQEQDSYGGKFDRSQSFVGEIGDLYMW
DSVLPPENILSAYQGTPLPANILDWQALNYEIRGYVIIKPLVWV
Chain D (204 residues): Blast Uniprot
HTDLSGKVFVFPRESVTDHVNLITPLEKPLQNFTLCFRAYSDLSRAYSLFSYNTQGRDNELLVYKERVGEYSLYIGRHKV
TSKVIEKFPAPVHICVSWESSSGIAEFWINGTPLVKKGLRQGYFVEAQPKIVLGQEQDSYGGKFDRSQSFVGEIGDLYMW
DSVLPPENILSAYQGTPLPANILDWQALNYEIRGYVIIKPLVWV
Chain E (204 residues): Blast Uniprot
HTDLSGKVFVFPRESVTDHVNLITPLEKPLQNFTLCFRAYSDLSRAYSLFSYNTQGRDNELLVYKERVGEYSLYIGRHKV
TSKVIEKFPAPVHICVSWESSSGIAEFWINGTPLVKKGLRQGYFVEAQPKIVLGQEQDSYGGKFDRSQSFVGEIGDLYMW
DSVLPPENILSAYQGTPLPANILDWQALNYEIRGYVIIKPLVWV
Chain F (204 residues): Blast Uniprot
HTDLSGKVFVFPRESVTDHVNLITPLEKPLQNFTLCFRAYSDLSRAYSLFSYNTQGRDNELLVYKERVGEYSLYIGRHKV
TSKVIEKFPAPVHICVSWESSSGIAEFWINGTPLVKKGLRQGYFVEAQPKIVLGQEQDSYGGKFDRSQSFVGEIGDLYMW
DSVLPPENILSAYQGTPLPANILDWQALNYEIRGYVIIKPLVWV
Chain G (204 residues): Blast Uniprot
HTDLSGKVFVFPRESVTDHVNLITPLEKPLQNFTLCFRAYSDLSRAYSLFSYNTQGRDNELLVYKERVGEYSLYIGRHKV
TSKVIEKFPAPVHICVSWESSSGIAEFWINGTPLVKKGLRQGYFVEAQPKIVLGQEQDSYGGKFDRSQSFVGEIGDLYMW
DSVLPPENILSAYQGTPLPANILDWQALNYEIRGYVIIKPLVWV
Chain H (204 residues): Blast Uniprot
HTDLSGKVFVFPRESVTDHVNLITPLEKPLQNFTLCFRAYSDLSRAYSLFSYNTQGRDNELLVYKERVGEYSLYIGRHKV
TSKVIEKFPAPVHICVSWESSSGIAEFWINGTPLVKKGLRQGYFVEAQPKIVLGQEQDSYGGKFDRSQSFVGEIGDLYMW
DSVLPPENILSAYQGTPLPANILDWQALNYEIRGYVIIKPLVWV
Chain I (204 residues): Blast Uniprot
HTDLSGKVFVFPRESVTDHVNLITPLEKPLQNFTLCFRAYSDLSRAYSLFSYNTQGRDNELLVYKERVGEYSLYIGRHKV
TSKVIEKFPAPVHICVSWESSSGIAEFWINGTPLVKKGLRQGYFVEAQPKIVLGQEQDSYGGKFDRSQSFVGEIGDLYMW
DSVLPPENILSAYQGTPLPANILDWQALNYEIRGYVIIKPLVWV
Chain J (204 residues): Blast Uniprot
HTDLSGKVFVFPRESVTDHVNLITPLEKPLQNFTLCFRAYSDLSRAYSLFSYNTQGRDNELLVYKERVGEYSLYIGRHKV
TSKVIEKFPAPVHICVSWESSSGIAEFWINGTPLVKKGLRQGYFVEAQPKIVLGQEQDSYGGKFDRSQSFVGEIGDLYMW
DSVLPPENILSAYQGTPLPANILDWQALNYEIRGYVIIKPLVWV
Chain K (204 residues): Blast Uniprot
HTDLSGKVFVFPRESVTDHVNLITPLEKPLQNFTLCFRAYSDLSRAYSLFSYNTQGRDNELLVYKERVGEYSLYIGRHKV
TSKVIEKFPAPVHICVSWESSSGIAEFWINGTPLVKKGLRQGYFVEAQPKIVLGQEQDSYGGKFDRSQSFVGEIGDLYMW
DSVLPPENILSAYQGTPLPANILDWQALNYEIRGYVIIKPLVWV
Chain L (204 residues): Blast Uniprot
HTDLSGKVFVFPRESVTDHVNLITPLEKPLQNFTLCFRAYSDLSRAYSLFSYNTQGRDNELLVYKERVGEYSLYIGRHKV
TSKVIEKFPAPVHICVSWESSSGIAEFWINGTPLVKKGLRQGYFVEAQPKIVLGQEQDSYGGKFDRSQSFVGEIGDLYMW
DSVLPPENILSAYQGTPLPANILDWQALNYEIRGYVIIKPLVWV
Chain M (204 residues): Blast Uniprot
HTDLSGKVFVFPRESVTDHVNLITPLEKPLQNFTLCFRAYSDLSRAYSLFSYNTQGRDNELLVYKERVGEYSLYIGRHKV
TSKVIEKFPAPVHICVSWESSSGIAEFWINGTPLVKKGLRQGYFVEAQPKIVLGQEQDSYGGKFDRSQSFVGEIGDLYMW
DSVLPPENILSAYQGTPLPANILDWQALNYEIRGYVIIKPLVWV
Chain N (204 residues): Blast Uniprot
HTDLSGKVFVFPRESVTDHVNLITPLEKPLQNFTLCFRAYSDLSRAYSLFSYNTQGRDNELLVYKERVGEYSLYIGRHKV
TSKVIEKFPAPVHICVSWESSSGIAEFWINGTPLVKKGLRQGYFVEAQPKIVLGQEQDSYGGKFDRSQSFVGEIGDLYMW
DSVLPPENILSAYQGTPLPANILDWQALNYEIRGYVIIKPLVWV
Chain O (204 residues): Blast Uniprot
HTDLSGKVFVFPRESVTDHVNLITPLEKPLQNFTLCFRAYSDLSRAYSLFSYNTQGRDNELLVYKERVGEYSLYIGRHKV
TSKVIEKFPAPVHICVSWESSSGIAEFWINGTPLVKKGLRQGYFVEAQPKIVLGQEQDSYGGKFDRSQSFVGEIGDLYMW
DSVLPPENILSAYQGTPLPANILDWQALNYEIRGYVIIKPLVWV
Chain P (204 residues): Blast Uniprot
HTDLSGKVFVFPRESVTDHVNLITPLEKPLQNFTLCFRAYSDLSRAYSLFSYNTQGRDNELLVYKERVGEYSLYIGRHKV
TSKVIEKFPAPVHICVSWESSSGIAEFWINGTPLVKKGLRQGYFVEAQPKIVLGQEQDSYGGKFDRSQSFVGEIGDLYMW
DSVLPPENILSAYQGTPLPANILDWQALNYEIRGYVIIKPLVWV
Chain Q (204 residues): Blast Uniprot
HTDLSGKVFVFPRESVTDHVNLITPLEKPLQNFTLCFRAYSDLSRAYSLFSYNTQGRDNELLVYKERVGEYSLYIGRHKV
TSKVIEKFPAPVHICVSWESSSGIAEFWINGTPLVKKGLRQGYFVEAQPKIVLGQEQDSYGGKFDRSQSFVGEIGDLYMW
DSVLPPENILSAYQGTPLPANILDWQALNYEIRGYVIIKPLVWV
Chain R (204 residues): Blast Uniprot
HTDLSGKVFVFPRESVTDHVNLITPLEKPLQNFTLCFRAYSDLSRAYSLFSYNTQGRDNELLVYKERVGEYSLYIGRHKV
TSKVIEKFPAPVHICVSWESSSGIAEFWINGTPLVKKGLRQGYFVEAQPKIVLGQEQDSYGGKFDRSQSFVGEIGDLYMW
DSVLPPENILSAYQGTPLPANILDWQALNYEIRGYVIIKPLVWV
Chain S (204 residues): Blast Uniprot
HTDLSGKVFVFPRESVTDHVNLITPLEKPLQNFTLCFRAYSDLSRAYSLFSYNTQGRDNELLVYKERVGEYSLYIGRHKV
TSKVIEKFPAPVHICVSWESSSGIAEFWINGTPLVKKGLRQGYFVEAQPKIVLGQEQDSYGGKFDRSQSFVGEIGDLYMW
DSVLPPENILSAYQGTPLPANILDWQALNYEIRGYVIIKPLVWV
Chain T (204 residues): Blast Uniprot
HTDLSGKVFVFPRESVTDHVNLITPLEKPLQNFTLCFRAYSDLSRAYSLFSYNTQGRDNELLVYKERVGEYSLYIGRHKV
TSKVIEKFPAPVHICVSWESSSGIAEFWINGTPLVKKGLRQGYFVEAQPKIVLGQEQDSYGGKFDRSQSFVGEIGDLYMW
DSVLPPENILSAYQGTPLPANILDWQALNYEIRGYVIIKPLVWV


User comments


Links

 Search for 2a3w in:

Databases Visualization tools Analysis tools Quarternary structure
Personal tools